初期のページ画面
初期の設定では、 

このような画面です。
デフォルトで[FontPage]が設定されています。
Webタイトルを変える 
現在 Webタイトルは”PukiWiki Plus!”になっております。
それを変更するには
./pukiwiki.ini.php
183行目の
/////////////////////////////////////////////////
// Title of your Wikisite (Name this)
// Also used as RSS feed's channel name etc
$page_title = 'PukiWiki Plus!';
の 'PukiWiki Plus!' を任意の名前に変える
左下の Founded by anonymous. の名前を変える 
./pukiwiki.ini.php
209行目の
// Site admin's name (CHANGE THIS)
$modifier = 'anonymous';
の 'anonymous' を任意の名前に変える
./pukiwiki.ini.php
216行目の
// Default page name
$defaultpage = 'FrontPage'; // Top / Default page
の 'FrontPage' を任意のページに変える
上の画像を変える 
デフォルトでは
になってます。
画像の場所:./image/pukiwiki.plus_logo.png
./skin/default.skin.php
76行目の
<a href="<?php echo $modifierlink ?>"><img id="logo" src="<?php echo
IMAGE_URI; ?>pukiwiki.plus_logo.png" width="80" height="80" alt="[PukiWiki
Plus!]" title="[PukiWiki Plus!]" /></a>
ファイル名を変えるか、pukiwiki.plus_logo.png で画像を上書きする
サイズは80×80ピクセル、パーミッションは644
width="80" height="80"のところでサイズを変更してもOK